Synology NASはDS918+(DSM 6.2.3)です。WindowsPCとのデータのやりとりのため、NTFSフォーマットの外付けHDDにコピーする際に気がつきました。
ext4ならUSBやeSATA相当のスピードが出ますがNTFSだと読み書きともに遅くなります。それでも瞬間的には数十MB/sでますが、数MB/s程度が平均のような印象です。明らかに遅いとわかるスピードです。ext4なら100MB/sほど出ます（eSATA）。
Synology NASではexFATも有料アプリで扱えるようになりますが、ext4をWindowsで読めるようにしたほうが早そうだったのでNTFSやexFATではなく、ext4でにしました。
NASの部分的なバックアップなどで外付けHDDを使う場合はLinux系のフォーマットの方が良さそうです。